желательно использовать файловую систему FAT32, с NTFS есть проблемы в Gentoo Dr.Web. Отформатировать флешку можно с помощью утилиты Tools\USBFormat;
в некоторых дистрибутивах на новом оборудовании возможны проблемы с графическим режимом, используйте в таком случае консольный;
перед сканированием системы желательно обновить антивирусные базы, в случае если на проверяемой машине если доступ в сеть;
при работе с Kaspersky Rescue Disk на первом разделе вашего диска создается каталог «Kaspersky Rescue Disk 10.0» со служебными файлами (включает отчеты, файлы обновлений, карантин, скриншоты и др., инфо>). если на проверяемой машине объем системного раздела меньше 248Мб то образ работает непосредственно из RAM (не очень шустро);
в качестве бонуса дополнительно включены iso-образы загрузочных CD (версия av2012-x3.iso без антивируса Avira должна умещаться на обычный CD-R);